螢光測量在許多生物學（葉綠素和類胡蘿蔔素）、生物醫學（螢光病變診斷）和環境科學應用中是非常必要的一種手段。螢光測量通常需要高靈敏度的光譜儀(推薦AvaSpec-2048TEC，積分時間 > 5 seconds).對於大多數螢光應用來說，產生的螢光能量只占激發光能量的3%左右。螢光能量比激發光能量要小（所以波長要長），而且一般都是散射光（在各個方向上輻射能量）。

對於螢光光譜儀裝置來說最重要一點是防止激發光進入光譜儀，這可以通過不同方法實現，各種方法不互相排斥：

1. 使用AvaLight-LED作為激發光源（窄帶寬），激發光波長不在螢光光譜範圍內。 

2. 使用（干涉）帶通或低通濾光片與AvaLight-HAL光源一起得到高強度窄帶寬的激發光。

3. 確保激發光與螢光是90度正交的，這樣激發光不會進入接收光纖（使用CUV-UV/VIS-FL或CUV-DA）。

4. 利用螢光的延遲時間把激發光和螢光積分時間起始脈衝分離開。此時需要一個脈衝光源(脈衝雷射器或XE-2000閃光氙燈)和AvaSpec-2048FT快觸發光譜儀（可編程式控制制延遲時間）。

典型的螢光測量系統如圖所示。

螢光光譜儀測量常用配置

光譜儀

AvaSpec-2048光譜儀（可選-FT或-TEC型）

VA光柵（360-1100nm），200微米狹縫，DCL-UV/VIS靈敏度增強透鏡

軟體

AvaSoft-Full軟體

光源

AvaLight-LED475或AvaLight-HAL鹵素光源（帶CUV-HAL試管支架和干涉濾光片）

光纖探頭

1根FCR-UV200/600-2-IND螢光光纖（帶FCR-FLTIP-IND頭）

或2根FC-UV600-2光纖

附件

CUV-DA或CUV-HAL或CUV-FL-UV/VIS試管支架